La introducción de programas de bonos en Honduras produjo controversia sobre posibles efectos no intencionales del BMI en otros esfuerzos de programas de salud pública, especialmente la planificación familiar. El potencial de que un programa social afecte los resultados de un programa diferente se como "efecto cruzado". Tales efectos pueden funcionar en beneficio o detrimento de cualquiera de los programas o de ambos. En este caso, se sospechaba que se trataba de efectos en detrimento de los programas.

Algunos funcionarios de salud y planificación familiar estaban preocupados de que el BMI podría estar teniendo un efecto adverso sobre los servicios de planificación familiar y las conductas anticonceptivas en tres maneras: (1) ¿Servirían los subsidios en efectivo como subsidios para los costos de crianza de los hijos, elevando, entonces, la demanda de hijos? (2) ¿Querrían las mujeres embarazarse poco después del año prescrito para lactancia para volver a calificar para los bonos? Finalmente, (3) ¿serían las tareas administrativas asociadas al programa un recargo para el personal del centro de salud y una interferencia a su capacidad para proveer servicios de planificación familiar? Dado que las mujeres del grupo objetivo estaban en sus primeros años reproductivos, varias características del programa BMI eran motivo de preocupación. Por ejemplo, el número de beneficiarios potenciales por vivienda no estaba limitado. Puesto que los beneficios en efectivo del programa podían ser utilizados para otros propósitos distintos a la compra de alimento, podía hacer que la participación en el programa resultara muy atractiva para una gran cantidad de mujeres. En este estudio, los investigadores en evaluación buscaban posibles efectos "cruzados" del programa BMI en el uso de anticonceptivos, en las preferencias de fecundidad y en los niveles de fecundidad entre los beneficiarios del programa.

Para medir estos efectos potenciales, se usó un diseño de estudio cuasi-experimental para comparar tres grupos: (1) las beneficiarias del programa BMI, (2) las beneficiarias del Programa de Alimentación Materno Infantil (PAMI), un programa de ayuda alimentaria de CARE International y (3) mujeres en municipalidades socio-económicamente comparables que no estaban recibiendo asistencia alimentaria relacionada con el MCH.

Los datos fueron recolectados usando tres protocolos de encuestas. Un cuestionario del Centro de Salud produjo información sobre la infraestructura del establecimiento, el equipo y los suministros, el personal, los servicios ofrecidos y una valoración limitada de la calidad del servicio de planificación familiar. Un cuestionario sobre la comunidad recogía información sobre los sujetos de estudio a nivel individual, incluyendo antecedentes socio-económicos y composición de la vivienda, experiencia en crianza de hijos e intenciones de fecundidad, uso pasado y vigente de anticonceptivos, uso de servicios de planificación familiar y recibo de ayuda alimentaria y otros beneficios de programas de ayuda social. Los datos fueron recogidos en 60 establecimientos de salud, 345 comunidades y 1019 viviendas. Los investigadores compararon la conducta reproductiva y anticonceptiva de los tres grupos experimentales, controlando las características individuales, de vivienda y de comunidad en un modelo de regresión múltiple.

No se halló evidencia precisa de la existencia de un efecto cruzado del programa BMI sobre los esfuerzos de los programas nacionales de planificación familiar en Honduras. Al controlar estadísticamente otros factores, la fecundidad reciente de las beneficiarias de programas BMI no fue diferente de la de las mujeres que no habían recibido ayuda alimentaria. Lo mismo ocurrió respecto al deseo de tener más hijos, al uso de anticonceptivos modernos y las intenciones de usar anticonceptivos en el futuro. La única evidencia de un posible efecto pro-natalista del programa BMI fue que se reportaron mayores tamaños ideales de familia entre las participantes en el programa BMI. Sin embargo, las participantes del programa BMI también tenían un mayor tamaño promedio de familia que las que no participaban en ese programa y las mujeres entrevistadas en encuesta raramente declaran un tamaño familiar ideal menor que su tamaño familiar real. Por lo tanto, las respuestas de las participantes en el programa BMI tienden a reflejar estas diferencias preexistentes en el número de hijos.